Selv enkle reflux er ubehagelig, betyr det vanligvis ikke utgjøre en fare for friske individer. Fra halv til tre fjerdedeler av personer med reflukssykdom har milde symptomer som regel klare opp som svar på enkle tiltak. Over tid kan imidlertid alvorlige problemer utvikler når hyppige tilbakefall forbundet wih vedvarende GERD gå ubehandlet. Disse komplikasjonene kan omfatte innsnevring (striktur) i spiserøret, erosjon av sitt fôr, forstadier til endringer i sine celler, og esophageal magesår.
En komplikasjon, kjent som reflux esophagitis, er inflammasjon som oppstår når syre og pepsin, frigjøres fra magen, erodere områder av mucosa, overflatelaget av cellene på spiserøret. Foruten den brennende følelse av enkel halsbrann, kan pasienter med øsofagitt også klage over smerter bak brystbenet å spre seg i ryggen eller opp til halsen, kjeven, eller til og med ørene. Smerten kan være så intens at du kan ha problemer med å svelge og kan selv tror du har et hjerteinfarkt.
Med øsofagitt, kan maten føles som om det stikker i halsen før du går ned i spiserøret. Varme drikker er ubehagelig å svelge, og du kan ha litt kvalme. Du kan også gulpe opp noen syre væske i halsen, noe som resulterer i en hoste. Den betennelse i spiserøret kan også føre til blødninger. Endoskopi er nødvendig for å bekrefte diagnosen av øsofagitt og lokalisere eventuelle tilknyttede magesår eller strikturer. Blødende magesår i en betent spiserør kan kreve aggressiv behandling, for eksempel blodtransfusjoner og, for å stoppe blødningen, passerte en sonde gjennom en endoskopisk røret for å bruke elektrisitet eller varme, eller å injisere blodårer constricting agenter inn i blødningen. Strikturer kan trenge å bli utvidet gjennom endoskopi, ved hjelp av en ballong eller andre spesielle dilator. Om lag en tredjedel av pasientene som trenger denne prosedyren krever en rekke behandlinger for å fullt ut åpne passasjen.
En annen komplikasjon av kronisk spiserørsbetennelse er Barretts øsofagus, en abnormitet der høyere celler som ligner de som linje tynntarmen erstatte plateepitel eller flate celler som normalt den nederste delen spiserøret. Sykdommen, en potensiell konsekvens av langvarig GERD, er forårsaket av langvarig og alvorlig eksponering for syre fra magesekken og galle fra tynntarmen. Barretts øsofagus kan, over tid, utvikle seg til kreft, slik at pasientene blir oppfordret til å ha regelmessige endoskopiske evalueringer (inkludert biopsier) å identifisere tidlige maligne endringer. Personer mest utsatt er de som utviklet GERD i tidlig alder og har hatt det i mange år.
En studie rapporterte en høyere risiko for spiserørskreft i GERD pasienter, hvorvidt de har Barretts øsofagus. Heldigvis bare en svært liten prosentandel av pasienter med GERD vil utvikle esophageal kreft. Noen eksperter tror det er reflux av galle, i tillegg til syre, som øker risikoen for spiserørskreft.
GERD kan også føre til problemer med tennene, inkludert tap av tannemaljen. Og det kan føre til kramper i stemmebåndene (strupehode), blokkerer luftstrømmen til lungene. En studie har rapportert at slike spasmer kan forårsake søvnapné, en sykdom der puste ofte stopper for korte øyeblikk under søvn.